অভ্যাসগত গর্ভপাতের কাঠামোতে, জেনেটিক, শারীরবৃত্তীয়, অন্তঃস্রাবী, রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতা এবং সংক্রামক কারণগুলিকে আলাদা করা হয়। যখন উপরের সমস্ত কারণগুলি বাদ দেওয়া হয়, তখন একদল রোগী থেকে যায়, যাদের অভ্যাসগত গর্ভপাতের উৎপত্তি অস্পষ্ট (ইডিওপ্যাথিক গর্ভপাত)।