জন্মগত যক্ষ্মা বিরল। গর্ভাবস্থার প্রাথমিক পর্যায়ে ভ্রূণের সংক্রমণের ফলে স্বতঃস্ফূর্ত গর্ভপাত এবং মৃত শিশুর জন্ম হয়। যদি গর্ভাবস্থা অব্যাহত থাকে, তাহলে শিশুরা অকাল জন্মগ্রহণ করে, গর্ভাশয়ের অন্তঃসত্ত্বা হাইপোট্রফির লক্ষণ সহ, শরীরের ওজন কম থাকে। জন্মের পর প্রথম দিনগুলিতে, শিশুটি সুস্থ বলে মনে হতে পারে।